Vreme v okolici Blatnega jezera je kontinentalno s panonskim pridihom. To pomeni toplo in dokaj suho letno obdobje in pretežno mile zime. Vroče obdobje se začne v drugi polovici maja in traja do konca septembra. Temperature zraka se gibljejo med 25 – 35°C. Zaradi plitvega reliefa jezera le-to vsako zimo tudi zamrzne. Debelina ledu variira glede na zunanje temperature, velikokrat pa je po jezeru možno tudi drsati.